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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
23/03/2017 |
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Data da última atualização: |
27/12/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ARAUJO, J. L. S. de; RUMJANEK, N. G.; XAVIER, G. R.; ZILLI, J. E. |
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Afiliação: |
JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB; NORMA GOUVEA RUMJANEK, CNPAB; GUSTAVO RIBEIRO XAVIER, CNPAB; JERRI EDSON ZILLI, CNPAB. |
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Título: |
Draft genome sequence of Bradyrhizobium manausense strain BR 3351T, an effective symbiont isolated from Amazon rainforest. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Brazilian Journal of Microbiology, São Paulo, v. 48 n. 4, p. 1-2, out./dez. 2017. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.1016/j.bjm.2016.10.025 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The strain BR 3351T (Bradyrhizobium manausense) was obtained from nodules of cowpea (Vigna unguiculata L. Walp) growing in soil collected from Amazon rainforest. Furthermore, it was observed that the strain has high capacity to fix nitrogen symbiotically in symbioses with cowpea. We report here the draft genome sequence of strain BR 3351T. The information presented will be important for comparative analysis of nodulation and nitrogen fixation for diazotrophic bacteria. A draft genome with 9,145,311 bp and 62.9% of GC content was assembled in 127 scaffolds using 100 bp pair-end Illumina MiSeq system. The RAST annotation identified 8603 coding sequences, 51 RNAs genes, classified in 504 subsystems. |
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Palavras-Chave: |
Amazon forest; Biological nitrogen fixation; Cowpea; Next generation sequencing. |
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Thesaurus Nal: |
nodulation. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aThe strain BR 3351T (Bradyrhizobium manausense) was obtained from nodules of cowpea (Vigna unguiculata L. Walp) growing in soil collected from Amazon rainforest. Furthermore, it was observed that the strain has high capacity to fix nitrogen symbiotically in symbioses with cowpea. We report here the draft genome sequence of strain BR 3351T. The information presented will be important for comparative analysis of nodulation and nitrogen fixation for diazotrophic bacteria. A draft genome with 9,145,311 bp and 62.9% of GC content was assembled in 127 scaffolds using 100 bp pair-end Illumina MiSeq system. The RAST annotation identified 8603 coding sequences, 51 RNAs genes, classified in 504 subsystems.
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773 $tBrazilian Journal of Microbiology, São Paulo$gv. 48 n. 4, p. 1-2, out./dez. 2017.
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 163 | |
| 16. |  | PESSOA, D. D. V.; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I.; ARAUJO, J. L. S. de. The effect of sugarcane apoplastic fluidon the global gene expression pattern of strain HRC54 of Herbaspirillum seropedicae. In: SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN FIXATION, 16., LATINAMERICAN WORKSHOP OF PGPR, 4., RELARE, 19., 2018, Foz do Iguaçu. Book of abstract....Foz do Iguaçu: Emprapa, 2018. p. 55 Session 5, Short Note V.III| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 17. | | BAHIA, P. P.; ARAUJO, J. L. S. de; SOARES, L. H. de B.; REIS, V. M. Desenvolvimento de bioprocesso para produção de inoculante de cana-de-açúcar através do co-cultivo de duas espécies de herbaspirillum In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 32.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 16.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 14.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 11., FERTBIO 2016. Goiânia. Rumo aos novos desafios: anais. Goiânia: UFG, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 18. | | SILVA, F. V.; ARAÚJO, J. L. S. de; RUMJANEK, N. G.; SILVA JÚNIOR, J. P. Caracterização de Bradyrhizobium da região amazônica por ardra e sequenciamento do 16S rDNA. In: ENCONTRO NACIONAL DE MICROBIOLOGIA AMBIENTAL, 11., SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10., 2008, Fortaleza. Resumos... Fortaleza, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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